More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1994 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1806  chorismate synthase  98.9 
 
 		 362 aa  726    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1625  chorismate synthase  98.07 
 
 		 362 aa  721    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.511164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1994  chorismate synthase  100 
 
 		 362 aa  733    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  68.42 
 
 		 362 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  61.28 
 
 		 356 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  60.55 
 
 		 366 aa  454  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  60 
 
 		 354 aa  434  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  57.22 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  57.94 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  47.73 
 
 		 366 aa  328  9e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  47.31 
 
 		 361 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  45.2 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  45.56 
 
 		 365 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  46.82 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  44.6 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  47.11 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  44.6 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  46.82 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.18 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  46.99 
 
 		 376 aa  316  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  45.48 
 
 		 365 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  46.05 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  46.31 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  44.6 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  47.84 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  44.85 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  44.97 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  45.86 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  45.45 
 
 		 364 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  44.89 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  46.57 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  47.62 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  45.8 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  44.69 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  46.88 
 
 		 430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  44.97 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  46.48 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  45.56 
 
 		 369 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  45.35 
 
 		 370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  46.88 
 
 		 369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  46.88 
 
 		 369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  46 
 
 		 353 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  45.2 
 
 		 393 aa  308  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  46.2 
 
 		 364 aa  308  9e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  45.95 
 
 		 366 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  45.27 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  45.27 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  45.27 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.92 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.92 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  45.01 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  44.86 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.63 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.63 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.63 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  46.48 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  46.48 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  46.59 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  46.94 
 
 		 361 aa  305  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.13 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  44.7 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  44.66 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  44.67 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  45.87 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  44.8 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  45.09 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  45.09 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  43.82 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  44.99 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  45.63 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  44.63 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  46.82 
 
 		 328 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  44.54 
 
 		 355 aa  301  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  44.23 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  43.77 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  45.27 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  44.57 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  43.55 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  45.14 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  45.92 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  47.18 
 
 		 364 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  45.09 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  45.92 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  45.09 
 
 		 352 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  45.92 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  43.79 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  45.22 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  45.27 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  43.66 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2137  chorismate synthase  45.38 
 
 		 361 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.146002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>