More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_405 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  96.98 
 
 		 364 aa  723    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  100 
 
 		 364 aa  742    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  93.13 
 
 		 364 aa  701    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  50.42 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  49.86 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.14 
 
 		 365 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.88 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  46.34 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  45.92 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  47.59 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  44.51 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  44.2 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  44.13 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  43.82 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  45.33 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  45.81 
 
 		 368 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  46.81 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  45.11 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  44.38 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  44.01 
 
 		 360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  43.82 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  45.74 
 
 		 354 aa  301  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  43.54 
 
 		 365 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  47.22 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  43.54 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  44.92 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  45.25 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  44.85 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  44.69 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  44.94 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  44.94 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  46.5 
 
 		 362 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  44.19 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  44.51 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  45.28 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  43.54 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  47.06 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  47.9 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  44.35 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  45.89 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  46.24 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  45.38 
 
 		 359 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  45 
 
 		 363 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  44.75 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  40.77 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  44.66 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  44.85 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  45.1 
 
 		 362 aa  285  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  43.58 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  43.9 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  44.69 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  42.55 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  44.38 
 
 		 362 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  44.97 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  43.14 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  47.58 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  44.17 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  42.94 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  45.04 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  42.98 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  44.76 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  42.98 
 
 		 364 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  42.98 
 
 		 361 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  42.78 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  46.74 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  44.07 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  43.22 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0732  chorismate synthase  41.78 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0075518  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  45.53 
 
 		 368 aa  272  5.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.64 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  42.31 
 
 		 377 aa  272  5.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  42.82 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  43.3 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  41.64 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  41.64 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  43.06 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  43.94 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  43.22 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2427  chorismate synthase  39.73 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00147882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  43.34 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  40.78 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  43.09 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  44.04 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  42.94 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  42.49 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  42.21 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  42.21 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  41.13 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  44.48 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  42.13 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  42.21 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  41.24 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  42.21 
 
 		 366 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  41.08 
 
 		 361 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  41.24 
 
 		 366 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  43.26 
 
 		 366 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  45.58 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  42.21 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  43.09 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>