More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2427 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2427  chorismate synthase  100 
 
 		 392 aa  806    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00147882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0732  chorismate synthase  67.26 
 
 		 394 aa  532  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0075518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  45.45 
 
 		 365 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  45.99 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  44.76 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  43.32 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  43.58 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  43.32 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  41.8 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  41.8 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  41.07 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  41.27 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  40.58 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  43.12 
 
 		 363 aa  276  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  42.59 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  43.57 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  43.57 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  42.26 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  39.47 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  39.73 
 
 		 364 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  43.6 
 
 		 356 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  41.93 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  43.2 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  42.4 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  42.08 
 
 		 458 aa  265  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  43.2 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  42.78 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  42.78 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  42.78 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  40.72 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  42.44 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  43.62 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  45.07 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  41.33 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  41.3 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  41.3 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  42.26 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  42.48 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  40.93 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  42.16 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  42 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  40.05 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  42.26 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  40.21 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  42.56 
 
 		 361 aa  253  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  41.78 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  39.15 
 
 		 361 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  41.64 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  40.66 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  41.21 
 
 		 362 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  41.53 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  41.05 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  43.05 
 
 		 367 aa  250  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  39.53 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  40.8 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  40.8 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  42.56 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  42.22 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  42.18 
 
 		 369 aa  249  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  42.37 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  42.13 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  38.5 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  41.91 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  42.22 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  42.22 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  42.22 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  41.64 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  41.01 
 
 		 353 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  40.27 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  40.16 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  40.89 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  41.51 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  41.01 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  39.52 
 
 		 360 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  42.26 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  40.62 
 
 		 352 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  41.71 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  42.4 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  41.15 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  41.73 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  39.74 
 
 		 371 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  41.09 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  40.78 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  38.46 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  40.98 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  42.41 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  38.13 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  40.83 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  42.2 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  40.16 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  42.44 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  42.2 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  42.2 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  42.2 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  42.22 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  41.84 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  42.2 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  42.71 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  42.2 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>