More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2171 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  100 
 
 		 359 aa  730    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  64.86 
 
 		 353 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  63.69 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  61.21 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2726  chorismate synthase  62.22 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  54.36 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  52.43 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  54.73 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  52.39 
 
 		 365 aa  352  8e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2288  chorismate synthase  60.06 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000146456  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.99 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  50.42 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  49.86 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  50.42 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  50.71 
 
 		 367 aa  338  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  48.16 
 
 		 352 aa  335  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  48.03 
 
 		 369 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  48.16 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  48.16 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  47.88 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  47.88 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  47.88 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  50.7 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  48.3 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  47.84 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  48.42 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  47.56 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  45.08 
 
 		 377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  46.55 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  47.44 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.55 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  46.02 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  47.19 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  48.19 
 
 		 361 aa  316  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  46.31 
 
 		 361 aa  315  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.33 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  46.55 
 
 		 384 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  48.42 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  47.7 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  46.84 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  45.89 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  47.85 
 
 		 352 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  47.18 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  47.56 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  48.42 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  49 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  44.41 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  48.73 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  48.73 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  48.73 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  49.3 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  47.75 
 
 		 368 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  49.28 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  45.85 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  46.65 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  49.25 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  48.71 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  48.31 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  45.04 
 
 		 365 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  48.14 
 
 		 361 aa  305  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  48.14 
 
 		 361 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  48.14 
 
 		 361 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  45.9 
 
 		 373 aa  305  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  48.71 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  45.33 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  47.14 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  47.58 
 
 		 334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  45.3 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  45.3 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  45.27 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  46.07 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  46.67 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  44.83 
 
 		 371 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  44.35 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  47.34 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  47.9 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  46.81 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  46.93 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  45.45 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  45.27 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  48.2 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  44.99 
 
 		 366 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  47.04 
 
 		 370 aa  299  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  47.85 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  47.62 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  48.47 
 
 		 366 aa  298  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  42.86 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  42.86 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  46.45 
 
 		 364 aa  298  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  44.08 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  47.56 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  49.01 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  45.27 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  45.27 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  47.28 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  43.98 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  44.99 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  44.99 
 
 		 366 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  46.74 
 
 		 363 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>