More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0732 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0732  chorismate synthase  100 
 
 		 394 aa  802    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0075518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2427  chorismate synthase  67.26 
 
 		 392 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00147882  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  47.33 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  45.55 
 
 		 373 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  45.33 
 
 		 365 aa  316  6e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  42.86 
 
 		 364 aa  301  9e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  43.88 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  42.82 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  42.05 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  43.54 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  41.78 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  43.58 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  42.78 
 
 		 358 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  42.23 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  44.05 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  41.75 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  44.16 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  42.59 
 
 		 355 aa  279  8e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  42.31 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  43.46 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  42.89 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  42.37 
 
 		 360 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  43.54 
 
 		 363 aa  276  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  42.97 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  39.74 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.45 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  42.67 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  42.67 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  41.25 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  41.12 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  44.05 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  44.05 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  44.05 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  42.67 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  44.05 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  42.93 
 
 		 362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  44.05 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  42.4 
 
 		 359 aa  269  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.84 
 
 		 361 aa  269  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  42.36 
 
 		 366 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  43.51 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  41.04 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  42.18 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  43.77 
 
 		 362 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  42.13 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  40.8 
 
 		 365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  43.26 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  39.95 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  43.26 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  39.95 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  40.63 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  42.05 
 
 		 359 aa  266  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  41.33 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  43.12 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  42.63 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  42.42 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  42.4 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  42.4 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  42.4 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  43.95 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  41.69 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  41.39 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  41.36 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  45.19 
 
 		 351 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  42.4 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  42.71 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  41.16 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  43 
 
 		 361 aa  263  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  41.87 
 
 		 365 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  41.49 
 
 		 373 aa  262  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  41.32 
 
 		 364 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  40.53 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  40.63 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  40.78 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  40.87 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  42.51 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  43 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  42.13 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  40.21 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  42.49 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  43.57 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  40.77 
 
 		 366 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  37.83 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  40.36 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  40.36 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  40.84 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2288  chorismate synthase  44.38 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000146456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.27 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  40.53 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  40.21 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  41.47 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  44.26 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  42.36 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>