More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1873 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  100 
 
 		 390 aa  788    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  73.91 
 
 		 391 aa  617  1e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  54.5 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.55 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  52.1 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  48.77 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  50.14 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  48.34 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  50.14 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  47.22 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  47.47 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  49.72 
 
 		 362 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  49.72 
 
 		 362 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  47.47 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  47.68 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  50.56 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  49.03 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  47.65 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  46.54 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  49.86 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  47.47 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  46.78 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  48.07 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  43.88 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  49.02 
 
 		 366 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  47.21 
 
 		 361 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  49.03 
 
 		 362 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  49.86 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  46.78 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.91 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  46.93 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  45.63 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  48.61 
 
 		 370 aa  299  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  44.94 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  45.79 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  45.58 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  46.07 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  46.07 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  47.06 
 
 		 366 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  45.53 
 
 		 366 aa  296  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  47.47 
 
 		 363 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  45.03 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  47.9 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  45.22 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  44.23 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  44.17 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  45.66 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  44.17 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  46.5 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  46.07 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  46.11 
 
 		 366 aa  291  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  45.66 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  45.66 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  45.22 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  48.08 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  49.3 
 
 		 458 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  48.88 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  45.94 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  45.94 
 
 		 366 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  46.89 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.79 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.79 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  45.79 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.79 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  45.63 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  44.94 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  44.38 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  44.94 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.79 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  45.1 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  49.3 
 
 		 368 aa  288  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  45.73 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  44.13 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.94 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  44.2 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  48.03 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  44.04 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  45.22 
 
 		 370 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  46.5 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  45.68 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  46.52 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  45.07 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  42.29 
 
 		 373 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  45.66 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  47.75 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  46.85 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>