More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0530 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  100 
 
 		 365 aa  739    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  62.33 
 
 		 368 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  61.22 
 
 		 368 aa  444  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  60.39 
 
 		 365 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  59.28 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  50 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  48.63 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  45.05 
 
 		 364 aa  326  5e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  47.35 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  46.69 
 
 		 365 aa  317  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  44.51 
 
 		 364 aa  315  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  48.34 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  45.83 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  39.84 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  40.86 
 
 		 377 aa  279  7e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  45.25 
 
 		 364 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  40.27 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  42.9 
 
 		 364 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  45.28 
 
 		 358 aa  275  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  42.37 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  43.02 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  42.02 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  43.21 
 
 		 365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  45.79 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  43.58 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  40.28 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  43.14 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  43.14 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  44.23 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  45.14 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  45.33 
 
 		 370 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  42.54 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  44.13 
 
 		 362 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  41.62 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  41.24 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  41.13 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  39.43 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  42.11 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.06 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  42.58 
 
 		 362 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  41.24 
 
 		 369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  42.54 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  41.24 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  38.86 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  40.4 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  42.18 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  42.49 
 
 		 353 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  41.22 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  40.68 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  40.11 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  41.13 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  43.42 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  43.37 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  44.94 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  43.02 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  42.11 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  43.09 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.01 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  36.36 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  40.85 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  38.98 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  40.68 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  40.68 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  40.61 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  42.18 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  40.57 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  39.5 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  41.41 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  43.02 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  40.68 
 
 		 352 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  41.01 
 
 		 458 aa  244  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  39.28 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  39.27 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  41.57 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  39.83 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  41.34 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  38.98 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  39.83 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  41.13 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  42.34 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  41.41 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  40.4 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  41.13 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  39.83 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  39.89 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  41.13 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  41.13 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  40.28 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  41.41 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  39.15 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  41.24 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  43.38 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.33 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  39.89 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  41.06 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  40.06 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  41.88 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  39.89 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>