More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1763 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  97.8 
 
 
365 aa  679    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  100 
 
 
365 aa  738    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  83.47 
 
 
368 aa  615  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  80.49 
 
 
368 aa  599  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  60.39 
 
 
365 aa  464  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  48.76 
 
 
373 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  47.8 
 
 
365 aa  332  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  46.85 
 
 
366 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  44.97 
 
 
364 aa  323  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  44.69 
 
 
364 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  48.74 
 
 
391 aa  315  8e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  43.45 
 
 
364 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  40.78 
 
 
365 aa  292  7e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  41.33 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  47.34 
 
 
390 aa  280  4e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  44.41 
 
 
364 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  42.21 
 
 
363 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  40.97 
 
 
373 aa  276  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  44.17 
 
 
358 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  43.21 
 
 
358 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  48.43 
 
 
351 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  44.69 
 
 
334 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  38.68 
 
 
357 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  45.66 
 
 
362 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  38.68 
 
 
357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.06 
 
 
359 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  42.58 
 
 
363 aa  258  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  40 
 
 
360 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  45.17 
 
 
328 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  43.98 
 
 
362 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  43.98 
 
 
362 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  40.78 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  44.54 
 
 
362 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  45.61 
 
 
354 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  39.68 
 
 
386 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  43.47 
 
 
332 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  43.59 
 
 
354 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  43.7 
 
 
362 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  43.34 
 
 
367 aa  249  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  42.21 
 
 
359 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  44.35 
 
 
361 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1434  chorismate synthase  41.71 
 
 
383 aa  249  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  40.34 
 
 
354 aa  247  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  39.46 
 
 
373 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  41.94 
 
 
384 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  43.33 
 
 
370 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.6 
 
 
360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  41.46 
 
 
366 aa  245  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  45.04 
 
 
356 aa  245  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  38.98 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  45.01 
 
 
358 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2387  chorismate synthase  41 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  39.6 
 
 
352 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  43.14 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  38.7 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  37.82 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  41.36 
 
 
369 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  41.74 
 
 
364 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  41.92 
 
 
361 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  42.19 
 
 
360 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1114  chorismate synthase  38.77 
 
 
395 aa  242  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  41.13 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  42.58 
 
 
362 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  41.24 
 
 
361 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  40.32 
 
 
373 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  44.6 
 
 
358 aa  240  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  37.43 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  42.58 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  41.3 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  40.51 
 
 
384 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  43.79 
 
 
353 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.93 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  37.53 
 
 
365 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  42.21 
 
 
365 aa  239  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  41.93 
 
 
364 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  42.21 
 
 
364 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  42.21 
 
 
364 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  41.53 
 
 
370 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  42.21 
 
 
364 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2604  chorismate synthase  46.78 
 
 
331 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  41.67 
 
 
362 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  41.97 
 
 
364 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  43.06 
 
 
362 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  38.64 
 
 
364 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  41.87 
 
 
361 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  41.08 
 
 
359 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  41.64 
 
 
357 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  44.35 
 
 
367 aa  236  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  41.87 
 
 
362 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  40 
 
 
363 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  42.78 
 
 
366 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  40.17 
 
 
361 aa  235  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  40.06 
 
 
364 aa  235  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  41.64 
 
 
364 aa  235  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  42.62 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  41.69 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  41.92 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.79 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  41.19 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  42.42 
 
 
371 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>