More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2420 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  100 
 
 		 366 aa  748    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  54.34 
 
 		 357 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  54.34 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  47.03 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  43.49 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  43.89 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  43.33 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  44.17 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  43.01 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.4 
 
 		 359 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  44.11 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  42.55 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  43.58 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  44.51 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  43.84 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  44.2 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  42.5 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  41.71 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  43.7 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  42.7 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  43.65 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  42.09 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  41.35 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  43.13 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  41.55 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  42.74 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  42.78 
 
 		 362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  42.78 
 
 		 362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  39.89 
 
 		 373 aa  269  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  43.77 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  39.44 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  41.32 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  41.85 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  41.42 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  42.34 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  41.55 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  37.64 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  43.02 
 
 		 368 aa  258  9e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  42.47 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  42.82 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  44.08 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  42.22 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  43.21 
 
 		 362 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  37.18 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  41 
 
 		 328 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  37.85 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  40.87 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  41.23 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  42.62 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  44.96 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  41.16 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  42.16 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  41.35 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  41.78 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  41.6 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  38.21 
 
 		 380 aa  252  9.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  39.85 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  39.83 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  41.64 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  39.83 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  40.76 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  40.33 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  41.78 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  40.33 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  41.06 
 
 		 458 aa  249  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  42.06 
 
 		 351 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  37.85 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  41.13 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  38.71 
 
 		 369 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  38.71 
 
 		 369 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  44.99 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  38.71 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  38.71 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  38.71 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  38.71 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  41.74 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  38.65 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  38.71 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  41.13 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  41.53 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  38.44 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1425  chorismate synthase  39.67 
 
 		 368 aa  243  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  40 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  39.78 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  39.25 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  43.44 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  39.25 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  38.98 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  38.46 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  39.19 
 
 		 367 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  39.25 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  39.62 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  38.71 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  38.24 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  38.75 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  38.75 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  38.48 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  38.75 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  37.84 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  37.93 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>