More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1649 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  100 
 
 		 357 aa  711    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  44.35 
 
 		 365 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  46.52 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  43.02 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  47.22 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  45.66 
 
 		 362 aa  298  8e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  46.39 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  42.45 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  46.02 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  42.3 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  40.56 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  39.94 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  41.83 
 
 		 373 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  41.97 
 
 		 363 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  40.56 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  38.83 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  40.27 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  42.21 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  41.48 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  40.68 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  42.09 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  38.92 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  41.88 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  41.67 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  39.08 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  41.34 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  40.73 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  39.72 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  39.38 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  40.78 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1625  chorismate synthase  39.2 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.511164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  38.98 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  40.06 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  40.06 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  38.31 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  37.85 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  40.5 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  42.13 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  42.7 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1994  chorismate synthase  38.92 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  37.57 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1806  chorismate synthase  38.64 
 
 		 362 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  38.1 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  40.22 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  39.2 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  39.27 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  39.89 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  41.62 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  38.55 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  40.78 
 
 		 362 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  38.24 
 
 		 354 aa  229  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  38.24 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  39.83 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  39.83 
 
 		 366 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  38.48 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  39.83 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  38.48 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  39.27 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  40 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  38.35 
 
 		 352 aa  225  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  39.27 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  39.83 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  39.33 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  38.48 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  39.33 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  39.33 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  40.34 
 
 		 354 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  39.61 
 
 		 369 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  39.33 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  39.33 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  38.98 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  38.7 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  38.7 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  39.22 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  39.55 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  39.55 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  42.06 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  39.33 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3961  chorismate synthase  40.56 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168181  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  38.7 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  39.19 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  39.55 
 
 		 364 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  38.42 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  35.51 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  39.04 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  37.08 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  40.11 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  38.42 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  37.92 
 
 		 362 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  38.84 
 
 		 361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  36.72 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  38.2 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  39.72 
 
 		 442 aa  219  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  39.22 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  35.23 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  38.31 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  37.92 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  38.65 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  35.59 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  40.4 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>