More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0780 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  97.8 
 
 		 365 aa  679    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  100 
 
 		 365 aa  737    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  83.47 
 
 		 368 aa  615  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  80.17 
 
 		 368 aa  592  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  59.28 
 
 		 365 aa  455  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  48.19 
 
 		 365 aa  328  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  47.93 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  46.56 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  44.29 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  48.18 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  43.58 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  42.62 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  40.22 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  40.8 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  46.78 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  40.7 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  44.13 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  41.36 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  43.89 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  48.43 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  42.94 
 
 		 358 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  38.97 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  44.69 
 
 		 334 aa  259  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  38.4 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  44.97 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  42.02 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  39.17 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  44.89 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  40.22 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  43.87 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  43.3 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  43.3 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  38.66 
 
 		 369 aa  248  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  45.33 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  42.21 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  40.06 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  43.85 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  44.08 
 
 		 361 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  38.89 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  43.14 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  43.1 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  39.89 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  42.47 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  42.61 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  43.25 
 
 		 370 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  38.98 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  44.44 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  38.7 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.05 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  38.42 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1434  chorismate synthase  40.61 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  41.3 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  43.5 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  41.53 
 
 		 361 aa  238  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  44.32 
 
 		 358 aa  238  9e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  41.64 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  41.08 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  43.17 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  41.64 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  42.46 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.93 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  42.58 
 
 		 362 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  40.51 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  40.22 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  44.48 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  41.69 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  41.08 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  42.21 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2387  chorismate synthase  39.89 
 
 		 383 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  41.5 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1114  chorismate synthase  38.24 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  37.26 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  41.93 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  41.93 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  41.69 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  41.87 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  38.35 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  41.93 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  41.93 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  44.35 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  41.87 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  39.25 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  42.42 
 
 		 362 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  42.5 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  41.64 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  42.15 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  41.64 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  40.85 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  42.35 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  41.69 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2604  chorismate synthase  46.2 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  41.57 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  39.44 
 
 		 363 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.79 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  40.91 
 
 		 354 aa  230  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  38.87 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  41.41 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  39.5 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>