More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1282 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  100 
 
 		 391 aa  799    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  73.91 
 
 		 390 aa  595  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  52.63 
 
 		 365 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  50 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.69 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  49.32 
 
 		 373 aa  329  6e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  46.2 
 
 		 364 aa  315  7e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  49.02 
 
 		 368 aa  315  8e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  44.9 
 
 		 363 aa  312  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  48.19 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  47.91 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  46.5 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  47.91 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  45.11 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  44.83 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  47.63 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  47.08 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  49.86 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  47.9 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  47.34 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  44.29 
 
 		 364 aa  303  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  46.81 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  44.95 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  47.35 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  46.52 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  46.37 
 
 		 362 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  45.66 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  44.8 
 
 		 373 aa  298  8e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  45.94 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  44.38 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  45.66 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  46.01 
 
 		 366 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  44.2 
 
 		 365 aa  297  3e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  46.22 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  45.66 
 
 		 366 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  46.5 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  47.08 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  46.09 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  47.06 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  45.79 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  45.4 
 
 		 361 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  45.76 
 
 		 352 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  44.38 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  44.38 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  44.82 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  44.82 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  45.83 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  44.82 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  45.63 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  45.38 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  45.05 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  44.82 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  45.94 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  45.4 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  48.74 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  44.82 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  44.82 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  46.22 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  46.5 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  45.1 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  46.5 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  44.82 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  45.66 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  45.07 
 
 		 364 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  48.48 
 
 		 361 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  44.89 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  46.22 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  44.54 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  48.18 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  47.65 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  45.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  45.88 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  44.08 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  46.76 
 
 		 334 aa  286  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  44.32 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  44.26 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  45.81 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  44.08 
 
 		 361 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  44.02 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  46.24 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  44.82 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.82 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.38 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  42.78 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  45.38 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  46.26 
 
 		 361 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  47.11 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  44.72 
 
 		 373 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  45.66 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>