More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0879 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  100 
 
 		 368 aa  736    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  83.24 
 
 		 365 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  83.47 
 
 		 365 aa  600  1e-170  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  76.9 
 
 		 368 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  61.22 
 
 		 365 aa  464  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.42 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.88 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  50.41 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  49.86 
 
 		 391 aa  319  5e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  45.25 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  45.25 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  45.25 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  41.27 
 
 		 377 aa  299  6e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  43.63 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  41.78 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  49.3 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  46.09 
 
 		 364 aa  281  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  39.66 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  45.66 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  49.57 
 
 		 351 aa  275  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  44.72 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  44.6 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  41.94 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.85 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  46.24 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  46.5 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  45.1 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  45.1 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  45.38 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  42.94 
 
 		 362 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  46.18 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  40.48 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  44.82 
 
 		 362 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  45.22 
 
 		 367 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  39.68 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  40.34 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  44.85 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  45.35 
 
 		 366 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  41.34 
 
 		 357 aa  252  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  37.61 
 
 		 357 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  44.38 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  44.73 
 
 		 354 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  44.89 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  37.61 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  43.01 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  46.33 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  41.81 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  39.89 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  42.94 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  45.21 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  40.11 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  43.7 
 
 		 362 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  43.44 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  42.78 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.53 
 
 		 360 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  40.4 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  42.03 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  41.69 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  40.05 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  44.44 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  41.29 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  42.9 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  39.39 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  42.61 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  40.06 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  39.55 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  41.93 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  43.63 
 
 		 356 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  42.33 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  41.69 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  44.26 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  41.74 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  40.79 
 
 		 384 aa  239  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  42.66 
 
 		 361 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  41.08 
 
 		 366 aa  238  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  41.36 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.64 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  41.36 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  41.36 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  41.36 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  42.7 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  41.83 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  41.08 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  41.78 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  42.08 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  39.66 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  36.62 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  43.33 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  44.75 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  42.35 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  41.69 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  42.82 
 
 		 368 aa  235  8e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  42.58 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.51 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  41.08 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  42.62 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  41.94 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  40.95 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  41.08 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>