More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1943 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  100 
 
 		 332 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  46.31 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  46.31 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  44.2 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  44.75 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  45.68 
 
 		 362 aa  288  7e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  44.75 
 
 		 364 aa  288  8e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  46.02 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  48.66 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  41.08 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  41.71 
 
 		 363 aa  272  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  43.75 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  43.02 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  40.81 
 
 		 373 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  46.39 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  41.44 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  47.09 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  42.32 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  41.03 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  42.82 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  41.76 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  42.74 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  41.85 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  41.48 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  39.94 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  41.03 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  41.85 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.67 
 
 		 360 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  42.13 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  42.13 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  45.65 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  42.41 
 
 		 354 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  41.29 
 
 		 364 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  42.05 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  40.91 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  42.05 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  41.99 
 
 		 362 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  40.45 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  41.48 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  40.11 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  41.93 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  40.33 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  41.64 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  43.65 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  40.06 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  40.85 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  41.39 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  42.18 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  38.74 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  41.48 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  40.75 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  40.75 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  41.18 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  41.13 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  41.71 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  41.62 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  41.78 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  39.77 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  41.85 
 
 		 362 aa  242  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  43.18 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  41.69 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.23 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  39.88 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  40.06 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  40.46 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  39.61 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  40.06 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  41.57 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  41.36 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0855  chorismate synthase  44.35 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  41.53 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  39.22 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  39.22 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  41.48 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  42.13 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  39.22 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  39.22 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  39.77 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  39.42 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  39.22 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  40.11 
 
 		 361 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  41.62 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  40.06 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  40.11 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  42.2 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  40.68 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  40.91 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  39.2 
 
 		 363 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  39.2 
 
 		 363 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1566  chorismate synthase  41.62 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  38.74 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  40.56 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  40.56 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  40.62 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  39.77 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  42.33 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  42.33 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  41.93 
 
 		 362 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  42.33 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  42.61 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>