More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3850 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.71 
 
 
280 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.45 
 
 
292 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
286 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.217437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3634  Dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)-like protein  45.68 
 
 
259 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.04 
 
 
285 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.22 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
349 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.18 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  28.47 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  31.16 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  32.68 
 
 
598 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  30.89 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7223  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  30.73 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0519  hypothetical protein  42.05 
 
 
103 aa  63.5  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  30.85 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  29.51 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
335 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000012318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.15 
 
 
312 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.38 
 
 
268 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  26.96 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02715  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.12399 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  23.76 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.81 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  30.85 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  26.63 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  29.61 
 
 
661 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  25.24 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  28.37 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 
289 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  28.62 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 
326 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01165  conserved hypothetical protein similar to 3-ketosphinganine reductase (Eurofung)  31.52 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.457401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.22 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  29.85 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2473  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  23.9 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  26 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  29.41 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32314  predicted protein  33.07 
 
 
388 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  29.41 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  26.72 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.41 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>