221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5044 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.217437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3634  Dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)-like protein  41.97 
 
 
259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
294 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
292 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  29.09 
 
 
598 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
349 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.22 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02715  conserved hypothetical protein  24.07 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.12399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
253 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.78 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
292 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
285 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  26.48 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  23.53 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  25.37 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  28.24 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
271 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  23.98 
 
 
321 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16460  oxdoreductase  35.9 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  24.26 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.19 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29217  predicted protein  25.56 
 
 
393 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00905  oxidoreductase protein  35.16 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.870044 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  22.96 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.11 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  22.96 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  26.73 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.7 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.5 
 
 
328 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0928  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.5 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
280 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.17 
 
 
304 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.04 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.64 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 
310 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  27.5 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  18.02 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  26.53 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  28.38 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.44 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  26.53 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  26.53 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.19 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.19 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.19 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
241 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  23.03 
 
 
661 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626733  normal  0.253561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  28.08 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 
278 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.207273  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01165  conserved hypothetical protein similar to 3-ketosphinganine reductase (Eurofung)  32.93 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.457401  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2020  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.96 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.93 
 
 
335 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  25.93 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.61 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.7 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  25.85 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  31.78 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  26.06 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  24.41 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2473  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
246 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>