More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1920 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
290 aa  567  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
288 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
292 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
292 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
326 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
297 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
309 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
291 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
281 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
285 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
288 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
289 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
326 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  34.8 
 
 
598 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
349 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
281 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
279 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
286 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
315 aa  146  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 
300 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00870669  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
271 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
276 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.39 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
295 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
298 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
305 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  31.12 
 
 
308 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  31.89 
 
 
320 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.29 
 
 
274 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
307 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  35.44 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0384845  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  31.47 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
303 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
305 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  33.67 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
280 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
299 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
298 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
304 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
303 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
307 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
306 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
278 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  29.65 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
306 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
288 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
312 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.93 
 
 
272 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
273 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  34.68 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7223  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
274 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.39 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
327 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  33.11 
 
 
301 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
269 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  29.67 
 
 
318 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  34.67 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0363  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.66 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177062  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  29.07 
 
 
325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.01 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
312 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  29.71 
 
 
321 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  34 
 
 
306 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>