245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3634 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3634  Dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)-like protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
286 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.217437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
292 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 
280 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.74 
 
 
285 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
286 aa  121  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
326 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
292 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
292 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
281 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  30.81 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  28.72 
 
 
320 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.84 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  27.46 
 
 
321 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  24.88 
 
 
308 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  29.88 
 
 
301 aa  62  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16460  oxdoreductase  27.43 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
284 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
257 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  33.06 
 
 
296 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  27.27 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.9 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  25.37 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_003296  RS00905  oxidoreductase protein  27.11 
 
 
302 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.870044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
315 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 
302 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  27.07 
 
 
329 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  27.38 
 
 
311 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.86 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  27.08 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.06 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
313 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.02424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
300 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
300 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
338 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
305 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.88 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 
261 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  24.88 
 
 
300 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0475  putative oxidoreductase protein  31.69 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.597423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0519  hypothetical protein  34.07 
 
 
103 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29217  predicted protein  31.15 
 
 
393 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 
306 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
320 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  31.93 
 
 
328 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  32.5 
 
 
598 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.42 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  28.83 
 
 
319 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  26.89 
 
 
271 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07799  Uncharacterized oxidoreductase AN7799 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AV81]  28.7 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2241  putative short chain dehydrogenase  31.86 
 
 
255 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0081  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.346377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>