94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0475 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0475  putative oxidoreductase protein  100 
 
 		 297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.597423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16460  oxdoreductase  60 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00905  oxidoreductase protein  60 
 
 		 302 aa  345  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.870044 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3634  Dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)-like protein  33.12 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.91 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.09 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02715  conserved hypothetical protein  23.98 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.27 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.93 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  23.7 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.6 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5573  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.02 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.217437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.39 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.46 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.11 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.96 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  24.56 
 
 		 271 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.62 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32314  predicted protein  26.43 
 
 		 388 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01596  conserved hypothetical protein  23.04 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  24.27 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00023  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16570)  31.91 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.63949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.32 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47583  predicted protein  22.87 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.47 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.47 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.26 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  24.06 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.72 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66867  predicted protein  23.91 
 
 		 463 aa  46.6  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  23.22 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  26.46 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  22.79 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.82 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00270  oxidoreductase, putative  25.6 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.169466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  29.32 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.7 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11122  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0829795 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  24.06 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  26.27 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04726  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G10790)  29.17 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.934862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  25.58 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.44 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0384845  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.47 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.07 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.16 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.08 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  31.93 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  25.1 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  23.13 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.48 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  20.78 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 510 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.44 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  26.4 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.29 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  23.81 
 
 		 228 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>