More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66867 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_66867  predicted protein  100 
 
 
463 aa  957    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.445197 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04726  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G10790)  43.17 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.934862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
301 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
312 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  31.79 
 
 
316 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
317 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
320 aa  106  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
326 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
349 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 
314 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.07 
 
 
328 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
297 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 
305 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  28.35 
 
 
317 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
316 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
292 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.07 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  28.75 
 
 
333 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  28.75 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
298 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
289 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
289 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
289 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
304 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  31.27 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
307 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
305 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
290 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 
327 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
312 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
322 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
312 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
314 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
298 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  26.76 
 
 
318 aa  87  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
306 aa  87  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
303 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
285 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  29.11 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.11 
 
 
300 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.11 
 
 
300 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
314 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  30.82 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  30.39 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
315 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 
299 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
289 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  30.26 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 
318 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 
305 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  31.14 
 
 
292 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  30.49 
 
 
302 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
304 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
306 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.03 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
313 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.3 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  29.43 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  29.43 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  29.81 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  30.51 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  29.43 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  29.13 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  29.34 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4041  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138801  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
288 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  29.66 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  27.19 
 
 
309 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>