127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16460  oxdoreductase  100 
 
 
309 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00905  oxidoreductase protein  77.21 
 
 
302 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.870044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0475  putative oxidoreductase protein  63.67 
 
 
297 aa  329  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.597423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.91 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
288 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02715  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.12399 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01596  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.22 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.44 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32314  predicted protein  35.29 
 
 
388 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04726  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G10790)  30.65 
 
 
453 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.934862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.78 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3634  Dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)-like protein  27.43 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  21 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1554  hypothetical protein  56.86 
 
 
51 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.385384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.59 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 
303 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 
286 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  27.14 
 
 
317 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.217437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  26.97 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  25.33 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.32 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  24.14 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.85 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  24.35 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.12 
 
 
308 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  30.88 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  25.59 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.67 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.56 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.42 
 
 
253 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000241123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.28 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.47 
 
 
335 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  23.67 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10094  hypothetical protein  31.15 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.151541  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.7 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.1 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7223  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.81 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.09 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2697  putative daunorubicin C-13 ketoreductase  25.76 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114176  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.39 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.26 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981527  normal  0.0865499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
306 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  21.33 
 
 
284 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.66 
 
 
322 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.52 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5573  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.43 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
241 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.64 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.42 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.35 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.73 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  25.38 
 
 
598 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10169  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (AFU_orthologue; AFUA_1G10100)  28.89 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  22.4 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>