More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0501 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 
258 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
260 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
344 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  28.35 
 
 
269 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
272 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
273 aa  119  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
267 aa  118  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  26.4 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  31.6 
 
 
237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 
355 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.46 
 
 
264 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.07 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.07 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.07 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.07 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  29.46 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
262 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
264 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 
238 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.07 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.05 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
267 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
276 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
239 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.68 
 
 
277 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.29 
 
 
264 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
276 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
277 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  27.1 
 
 
267 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.29 
 
 
264 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
284 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
262 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
238 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
276 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
303 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
277 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
305 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
242 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  28.68 
 
 
267 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
242 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
242 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
242 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
242 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  27.55 
 
 
267 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
229 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0481676 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  31.71 
 
 
263 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
293 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
369 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
266 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
276 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
277 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 
332 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 
281 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.71 
 
 
249 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
354 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
252 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.91 
 
 
238 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.85 
 
 
274 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.44 
 
 
280 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
239 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  28.74 
 
 
279 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
267 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
267 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
276 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
249 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.08 
 
 
277 aa  102  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
272 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.02 
 
 
257 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  27.55 
 
 
267 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
280 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
275 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
275 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
295 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  27.55 
 
 
267 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.59 
 
 
266 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
240 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  30 
 
 
337 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 
287 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>