More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2906 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  89.88 
 
 
257 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
264 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
263 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
267 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
260 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.76 
 
 
258 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
263 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
262 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
262 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
259 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  39.45 
 
 
259 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
266 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  39.06 
 
 
259 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
344 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
257 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
259 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.25 
 
 
258 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
259 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
360 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  39.37 
 
 
261 aa  175  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.08 
 
 
266 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
263 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
256 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
257 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
261 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
262 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
262 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
259 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  37.6 
 
 
275 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
289 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
276 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
262 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  35.94 
 
 
259 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
261 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
275 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
261 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
298 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
267 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
256 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  39.06 
 
 
264 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
272 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
260 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
258 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
260 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
264 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
259 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  34.12 
 
 
258 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
264 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
255 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
260 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.18 
 
 
260 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
260 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
343 aa  148  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  30.33 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
258 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
265 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
289 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
258 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
265 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
255 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
269 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.71 
 
 
261 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
266 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
291 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.88 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.45506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
271 aa  138  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
264 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
250 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
266 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
267 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
256 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
259 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.31 
 
 
259 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
257 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>