More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6402 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 277 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 		 268 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25903 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  39.57 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 267 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 267 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.32 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.32 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.57 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.57 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.95 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  28.57 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.45 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 328 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.44 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176242  normal  0.778008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 248 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  32.46 
 
 		 847 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.27 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.12 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>