More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0245 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.25903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.81 
 
 
272 aa  318  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
266 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
262 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
274 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
266 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
263 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
269 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.89 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 
269 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
268 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  35.37 
 
 
237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 
267 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
270 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 
270 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
233 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
267 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
276 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
267 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.25 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
267 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
267 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
267 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 
270 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
267 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
267 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
347 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
272 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  34.55 
 
 
847 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
257 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
309 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
260 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
295 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3359  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
245 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.711372  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1215  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.9 
 
 
245 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.765065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.9 
 
 
239 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
278 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
261 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
271 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
286 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
242 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
242 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
242 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
242 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
238 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
242 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
242 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 
239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
273 aa  106  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
283 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820059  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
271 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
284 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.34 
 
 
258 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 
284 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
253 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 
238 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
265 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.28 
 
 
302 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
251 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
279 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
284 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.68 
 
 
245 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.03 
 
 
239 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.28 
 
 
302 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.25 
 
 
276 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
246 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
285 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  32.98 
 
 
847 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
244 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.72 
 
 
245 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
338 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
280 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  30.2 
 
 
264 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
276 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
295 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.89 
 
 
302 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
282 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0497  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.46 
 
 
245 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.89 
 
 
302 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  33.04 
 
 
278 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.1 
 
 
302 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.29 
 
 
245 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
279 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>