More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2430 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.81 
 
 		 266 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.97 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  37.37 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  35.32 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  36.76 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  36.32 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  31.66 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.99 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  28.52 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.53 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.8 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  34.22 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.49 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000158661  hitchhiker  0.0000072353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  34.9 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.88 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.33 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.67 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  32.13 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3406  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.7 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>