More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36881 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  635    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
263 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
266 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
266 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
272 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
263 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.25903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 
269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
264 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 
267 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
268 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
267 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
267 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
267 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
267 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
267 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
267 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 
267 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.13 
 
 
264 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
267 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
267 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 
276 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
351 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  32.18 
 
 
269 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.85 
 
 
264 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.85 
 
 
264 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.85 
 
 
264 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
255 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  34.34 
 
 
264 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.34 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.85 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
264 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
264 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.37 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  35.5 
 
 
237 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
273 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
312 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 
279 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
274 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
291 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.83 
 
 
264 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
282 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
307 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 
261 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
272 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.68 
 
 
238 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
309 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
296 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
309 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.32 
 
 
264 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  30.25 
 
 
295 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
248 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
327 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
275 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
276 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 
270 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
282 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 
253 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.361501  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
354 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 
267 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
245 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
296 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  27.24 
 
 
291 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 
239 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  27.59 
 
 
291 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  27.59 
 
 
281 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
281 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
311 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
347 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
275 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 
250 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 
250 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.45 
 
 
268 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.62 
 
 
290 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
312 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
264 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.45 
 
 
268 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.29 
 
 
246 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
293 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.38 
 
 
247 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
268 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>