More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4665 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.07 
 
 		 269 aa  326  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  43.23 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.29 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.9 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.12 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.9 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.12 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.12 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.51 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.12 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  33.73 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.04 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.85 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.57 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 		 339 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>