More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2740 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  64.04 
 
 		 587 aa  745    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  73.93 
 
 		 583 aa  881    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  70.36 
 
 		 585 aa  832    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  71.68 
 
 		 584 aa  863    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  77.22 
 
 		 583 aa  882    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  65.25 
 
 		 584 aa  759    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  100 
 
 		 579 aa  1190    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  38.23 
 
 		 607 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.91 
 
 		 621 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.05 
 
 		 596 aa  257  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  30.41 
 
 		 600 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  31.02 
 
 		 617 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31.83 
 
 		 542 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.22 
 
 		 622 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.23 
 
 		 602 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 620 aa  236  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.01 
 
 		 636 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.26 
 
 		 553 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.62 
 
 		 542 aa  216  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 		 621 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  31.93 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  30.12 
 
 		 530 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  31.86 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  29.73 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  29.27 
 
 		 545 aa  203  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.48 
 
 		 537 aa  203  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.53 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  31.85 
 
 		 536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.97 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.06 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.34 
 
 		 554 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  28.11 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.87 
 
 		 552 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  30.43 
 
 		 531 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.87 
 
 		 543 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.16 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.56 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.56 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.47 
 
 		 544 aa  194  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.57 
 
 		 550 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  27.72 
 
 		 557 aa  193  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  32.12 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  27.35 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.78 
 
 		 560 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.78 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.24 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.3 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  28.22 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.8 
 
 		 541 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.32 
 
 		 547 aa  190  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.72 
 
 		 543 aa  190  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.83 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  29.05 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  29.05 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  29.05 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.2 
 
 		 567 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.41 
 
 		 566 aa  188  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.66 
 
 		 560 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.65 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  31.42 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.91 
 
 		 550 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  29.26 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.74 
 
 		 627 aa  188  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  28.73 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.7 
 
 		 546 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.91 
 
 		 554 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.7 
 
 		 546 aa  187  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.7 
 
 		 546 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  29.26 
 
 		 541 aa  187  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.68 
 
 		 582 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.9 
 
 		 555 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.66 
 
 		 554 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.35 
 
 		 575 aa  186  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.08 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.5 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.38 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  27.38 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  29.95 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.54 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 		 553 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  28.19 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  25.74 
 
 		 604 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  28.72 
 
 		 541 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  29.53 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.02 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  31.57 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1109  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.93 
 
 		 626 aa  181  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  26.62 
 
 		 583 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  27.48 
 
 		 541 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.41 
 
 		 578 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.25 
 
 		 555 aa  180  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.73 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>