More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3143 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  100 
 
 		 542 aa  1116    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  47.2 
 
 		 531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  45.68 
 
 		 528 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  45.19 
 
 		 530 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  41.31 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  44.92 
 
 		 537 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  43.76 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  42.46 
 
 		 542 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  40.58 
 
 		 536 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  41.13 
 
 		 539 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  36.26 
 
 		 553 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.23 
 
 		 550 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  39.66 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  38.56 
 
 		 534 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  37.7 
 
 		 559 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  36.76 
 
 		 556 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 		 534 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  39.71 
 
 		 548 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  39.53 
 
 		 547 aa  317  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  35.04 
 
 		 562 aa  316  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.19 
 
 		 555 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  38.48 
 
 		 552 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.61 
 
 		 555 aa  309  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.5 
 
 		 560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.5 
 
 		 560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  34.66 
 
 		 557 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.14 
 
 		 567 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.09 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.81 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.39 
 
 		 550 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.27 
 
 		 560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  35.87 
 
 		 545 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.99 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.68 
 
 		 554 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.08 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.17 
 
 		 560 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.42 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  35.21 
 
 		 565 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  34.12 
 
 		 542 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.54 
 
 		 575 aa  296  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.7 
 
 		 553 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.58 
 
 		 558 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.58 
 
 		 558 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.58 
 
 		 558 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.58 
 
 		 558 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.58 
 
 		 558 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.58 
 
 		 558 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  35.22 
 
 		 570 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.58 
 
 		 558 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  35.09 
 
 		 562 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.3 
 
 		 578 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.48 
 
 		 552 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.48 
 
 		 552 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  33.46 
 
 		 566 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.09 
 
 		 560 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.5 
 
 		 544 aa  293  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.06 
 
 		 554 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.02 
 
 		 578 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.06 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.38 
 
 		 563 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.55 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 545 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 		 543 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  34.58 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 		 555 aa  289  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  36.44 
 
 		 546 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.16 
 
 		 567 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 595 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.45 
 
 		 541 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  32.36 
 
 		 569 aa  286  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  32.55 
 
 		 544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  40 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.79 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  33.27 
 
 		 541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.64 
 
 		 581 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  40 
 
 		 556 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.8 
 
 		 543 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  32.6 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.78 
 
 		 566 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  32.91 
 
 		 541 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  32.91 
 
 		 541 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  32.91 
 
 		 541 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  32.91 
 
 		 541 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  35.36 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  33.09 
 
 		 541 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.37 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.37 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.37 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  35.58 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  32.91 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  33.21 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.63 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  32.22 
 
 		 542 aa  279  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.03 
 
 		 541 aa  279  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  40.05 
 
 		 548 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.05 
 
 		 548 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.05 
 
 		 548 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.05 
 
 		 548 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>