More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2597 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 553 aa  1136    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  39.61 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  38.1 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  37.48 
 
 		 539 aa  360  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.07 
 
 		 550 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  36.22 
 
 		 542 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  37.75 
 
 		 531 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  38.16 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  39.29 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  37.59 
 
 		 542 aa  339  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  35.97 
 
 		 528 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  36.64 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  37.37 
 
 		 548 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  35.83 
 
 		 530 aa  316  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  37.8 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  37.18 
 
 		 537 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.78 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  39.23 
 
 		 545 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.41 
 
 		 550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  33.65 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.99 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.99 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.99 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.99 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  34.55 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.66 
 
 		 575 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.35 
 
 		 567 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.85 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  35.55 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.81 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  31.66 
 
 		 556 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.45 
 
 		 532 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  31.66 
 
 		 556 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 554 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 554 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.1 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.64 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.64 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.79 
 
 		 541 aa  269  8e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.43 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  34.3 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.95 
 
 		 552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.09 
 
 		 555 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 		 610 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.46 
 
 		 553 aa  266  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  36.74 
 
 		 545 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.67 
 
 		 610 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.74 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.06 
 
 		 607 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.39 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  31.71 
 
 		 547 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  40.61 
 
 		 569 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.38 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.83 
 
 		 609 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  31.17 
 
 		 542 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.15 
 
 		 577 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  38.06 
 
 		 545 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.57 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  36 
 
 		 555 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  36.38 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.8 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  30.79 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.96 
 
 		 616 aa  257  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.41 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.73 
 
 		 560 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.1 
 
 		 597 aa  256  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.24 
 
 		 554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.21 
 
 		 543 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.92 
 
 		 541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  31.08 
 
 		 616 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.29 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.29 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  33.52 
 
 		 542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.29 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  36.59 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  36.59 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  36.59 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  30.36 
 
 		 614 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.35 
 
 		 557 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  38.79 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  33.21 
 
 		 528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  33.21 
 
 		 528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  32.27 
 
 		 617 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  36.59 
 
 		 541 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  34.33 
 
 		 541 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  31.89 
 
 		 567 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  36.36 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 560 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  30.29 
 
 		 624 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  38.79 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 560 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.35 
 
 		 614 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  36.58 
 
 		 541 aa  251  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  38.52 
 
 		 541 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>