More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3466 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1093    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  72.2 
 
 		 536 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  55.39 
 
 		 528 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  55.41 
 
 		 542 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  54.14 
 
 		 530 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  52.99 
 
 		 536 aa  568  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  52.7 
 
 		 537 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  47.28 
 
 		 542 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  40.33 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  40.19 
 
 		 536 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  41.23 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  37.39 
 
 		 556 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.42 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  38.39 
 
 		 562 aa  355  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  40.79 
 
 		 534 aa  353  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  38.48 
 
 		 553 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  38.55 
 
 		 559 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  37.84 
 
 		 552 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.45 
 
 		 550 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  36.92 
 
 		 548 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.24 
 
 		 552 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.43 
 
 		 552 aa  323  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.53 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 558 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 558 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 558 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 558 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  35.04 
 
 		 550 aa  317  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.34 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.34 
 
 		 554 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.73 
 
 		 567 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.8 
 
 		 553 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.84 
 
 		 555 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.84 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.61 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.21 
 
 		 554 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  35.02 
 
 		 545 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.21 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  35.19 
 
 		 528 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  35.19 
 
 		 528 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.1 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  36.11 
 
 		 547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 		 553 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.81 
 
 		 555 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.39 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  35.21 
 
 		 541 aa  300  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  35.58 
 
 		 541 aa  300  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  34.51 
 
 		 542 aa  299  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  41.32 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  33.9 
 
 		 614 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.57 
 
 		 543 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  35.2 
 
 		 545 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  36.95 
 
 		 545 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 		 575 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  35.39 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.15 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  33.82 
 
 		 556 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36 
 
 		 548 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  34.9 
 
 		 541 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  36 
 
 		 548 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  32.7 
 
 		 605 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3318  protein translocase subunit YidC  37.43 
 
 		 557 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.15 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  34.51 
 
 		 544 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.8 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.8 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  35.02 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.63 
 
 		 541 aa  295  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  36.04 
 
 		 548 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 		 541 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 560 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 567 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 548 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  35.84 
 
 		 548 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  32.34 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  32.15 
 
 		 569 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  34.18 
 
 		 617 aa  293  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 548 aa  293  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 548 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 548 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 548 aa  293  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 548 aa  293  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 548 aa  293  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 		 560 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.64 
 
 		 548 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  32.55 
 
 		 616 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  34.48 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.87 
 
 		 560 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  34.85 
 
 		 562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.63 
 
 		 563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  37.37 
 
 		 546 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  32.13 
 
 		 589 aa  289  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  33.64 
 
 		 571 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>