More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2331 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
552 aa  1126    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  61.22 
 
 
547 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  53.41 
 
 
569 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  53.62 
 
 
552 aa  591  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  53.89 
 
 
546 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.37 
 
 
553 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.46 
 
 
554 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.79 
 
 
555 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.46 
 
 
554 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.52 
 
 
555 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.19 
 
 
550 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  48.22 
 
 
567 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  49.91 
 
 
570 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  47.41 
 
 
559 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  48.18 
 
 
553 aa  525  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.66 
 
 
554 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  48.28 
 
 
565 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.66 
 
 
554 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.13 
 
 
552 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  47.22 
 
 
569 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.42 
 
 
558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.42 
 
 
558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  47.94 
 
 
569 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.42 
 
 
558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.45 
 
 
557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  45.99 
 
 
571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.84 
 
 
552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.21 
 
 
553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.21 
 
 
553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.24 
 
 
558 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.24 
 
 
558 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.24 
 
 
558 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.24 
 
 
558 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  47.67 
 
 
570 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.86 
 
 
555 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  46.48 
 
 
580 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  46.38 
 
 
557 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  45.6 
 
 
562 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.94 
 
 
575 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.69 
 
 
560 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.51 
 
 
560 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.51 
 
 
560 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.51 
 
 
560 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  45.59 
 
 
545 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  45.71 
 
 
565 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.32 
 
 
578 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.23 
 
 
578 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  44.72 
 
 
550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.7 
 
 
557 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  46.29 
 
 
545 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  45.05 
 
 
557 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  44.68 
 
 
551 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.04 
 
 
567 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.01 
 
 
581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.26 
 
 
560 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3318  protein translocase subunit YidC  45.41 
 
 
557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  45.01 
 
 
570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  45.28 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.92 
 
 
563 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.91 
 
 
541 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  43.76 
 
 
557 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  44.82 
 
 
551 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  40.61 
 
 
556 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  40.61 
 
 
556 aa  425  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  42.73 
 
 
541 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.69 
 
 
567 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  42.36 
 
 
541 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  42.54 
 
 
541 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  42.54 
 
 
541 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  42.54 
 
 
541 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  42.54 
 
 
541 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  42.54 
 
 
541 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  42.54 
 
 
541 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.35 
 
 
543 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  42.54 
 
 
541 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  41.76 
 
 
545 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  41.45 
 
 
540 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.09 
 
 
540 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  40.3 
 
 
541 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.63 
 
 
544 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  40.96 
 
 
542 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.85 
 
 
543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  41.33 
 
 
544 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.2 
 
 
541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  41.67 
 
 
566 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
546 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.09 
 
 
565 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
546 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
546 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.53 
 
 
541 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.64 
 
 
548 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.75 
 
 
548 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.27 
 
 
543 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  40.41 
 
 
544 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  40.8 
 
 
541 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.64 
 
 
548 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.35 
 
 
545 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  39.23 
 
 
542 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>