More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0004 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 553 aa  1137    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.14 
 
 		 558 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.14 
 
 		 558 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.14 
 
 		 558 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.14 
 
 		 558 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.14 
 
 		 558 aa  681    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  56.34 
 
 		 565 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  74.01 
 
 		 555 aa  830    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.29 
 
 		 553 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.14 
 
 		 558 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.39 
 
 		 555 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.14 
 
 		 558 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.34 
 
 		 557 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.66 
 
 		 550 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.54 
 
 		 552 aa  700    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  89.17 
 
 		 554 aa  999    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.99 
 
 		 555 aa  823    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.22 
 
 		 552 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.79 
 
 		 554 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.79 
 
 		 554 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.22 
 
 		 552 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.94 
 
 		 552 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.57 
 
 		 553 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  88.09 
 
 		 554 aa  986    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  55.68 
 
 		 567 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  56.63 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  55.44 
 
 		 557 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  54.88 
 
 		 571 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  54.45 
 
 		 570 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  54.14 
 
 		 569 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  55.7 
 
 		 570 aa  604  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  54.26 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  54.29 
 
 		 559 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  53.26 
 
 		 580 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  51.97 
 
 		 557 aa  581  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  52.15 
 
 		 547 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  51.7 
 
 		 565 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  49.01 
 
 		 552 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  46.33 
 
 		 569 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  48.04 
 
 		 546 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  47.15 
 
 		 552 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.07 
 
 		 560 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.89 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.72 
 
 		 560 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.36 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.55 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.78 
 
 		 578 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  43.92 
 
 		 562 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.83 
 
 		 560 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.78 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.09 
 
 		 563 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  44.46 
 
 		 545 aa  445  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.58 
 
 		 581 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.41 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  43.91 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  41.01 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  40.6 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  42.37 
 
 		 545 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.35 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  39.68 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.77 
 
 		 567 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  39.89 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.39 
 
 		 541 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  39.79 
 
 		 556 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  39.06 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3318  protein translocase subunit YidC  43.26 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.42 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  39.61 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  38.88 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  39 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  39.05 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.37 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.7 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  38.92 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.15 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  38.92 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  38.92 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  38.74 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.61 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.79 
 
 		 543 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  38.27 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  38.45 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  38.27 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  38.14 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.14 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.12 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.54 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.12 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.12 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  38.25 
 
 		 545 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  38.23 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  38.22 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.66 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  40.44 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  40.44 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.37 
 
 		 564 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  37.16 
 
 		 542 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.17 
 
 		 548 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.17 
 
 		 548 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>