More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4264 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  78.39 
 
 
548 aa  897    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  78.57 
 
 
548 aa  897    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  81.07 
 
 
545 aa  931    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  91.16 
 
 
543 aa  1038    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.57 
 
 
548 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.39 
 
 
548 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  78.39 
 
 
548 aa  897    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.75 
 
 
548 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.39 
 
 
548 aa  895    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.57 
 
 
548 aa  897    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  80.55 
 
 
546 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.75 
 
 
548 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  80.55 
 
 
546 aa  907    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.57 
 
 
548 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.57 
 
 
548 aa  897    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.57 
 
 
548 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  87.68 
 
 
544 aa  999    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.31 
 
 
533 aa  685    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  85.85 
 
 
543 aa  979    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  79.3 
 
 
548 aa  901    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.57 
 
 
548 aa  897    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
543 aa  1120    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  78.39 
 
 
548 aa  894    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  80.55 
 
 
546 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  58 
 
 
541 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.97 
 
 
541 aa  634  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.65 
 
 
540 aa  625  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  57.92 
 
 
540 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.34 
 
 
541 aa  618  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  54.74 
 
 
541 aa  611  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  55.21 
 
 
541 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  54.11 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  54.11 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  54.11 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  54.11 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  54.48 
 
 
541 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  54.48 
 
 
541 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  53.92 
 
 
542 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  53.93 
 
 
541 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  54.21 
 
 
566 aa  594  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  53.1 
 
 
542 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  52.27 
 
 
545 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  51.45 
 
 
544 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  53.02 
 
 
541 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  51.09 
 
 
544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  51.28 
 
 
541 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  49.82 
 
 
543 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  50.09 
 
 
543 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.81 
 
 
560 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  44.56 
 
 
551 aa  485  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.63 
 
 
560 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.63 
 
 
560 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.63 
 
 
560 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.44 
 
 
557 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.83 
 
 
560 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.68 
 
 
575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  44.33 
 
 
562 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 
563 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.45 
 
 
578 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.45 
 
 
578 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.4 
 
 
567 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.72 
 
 
581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  42.51 
 
 
570 aa  442  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  39.93 
 
 
545 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.87 
 
 
566 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  41.21 
 
 
569 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  40.28 
 
 
557 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.14 
 
 
565 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  41.53 
 
 
545 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  41.45 
 
 
556 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  38.77 
 
 
562 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  41.42 
 
 
556 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3318  protein translocase subunit YidC  42.48 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  39.78 
 
 
552 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.86 
 
 
564 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  39.31 
 
 
551 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  42.14 
 
 
552 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  36.85 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  38.34 
 
 
566 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.56 
 
 
550 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.79 
 
 
567 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  38.16 
 
 
566 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04101  inner membrane protein, 60 kDa  46.09 
 
 
441 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.117414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  37.52 
 
 
550 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.82 
 
 
554 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.38 
 
 
552 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.82 
 
 
554 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 
558 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.74 
 
 
553 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 
558 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 
558 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 
558 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 
558 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  37.64 
 
 
546 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 
558 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 
558 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.47 
 
 
557 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.84 
 
 
552 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.24 
 
 
554 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.86 
 
 
553 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>