More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3458 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  89.35 
 
 		 553 aa  1023    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.35 
 
 		 558 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  56.06 
 
 		 565 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.35 
 
 		 558 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.81 
 
 		 553 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.35 
 
 		 558 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.02 
 
 		 555 aa  825    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.35 
 
 		 558 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  98.01 
 
 		 554 aa  1119    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.99 
 
 		 555 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.35 
 
 		 558 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.35 
 
 		 558 aa  668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.14 
 
 		 554 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.35 
 
 		 558 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.25 
 
 		 557 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.89 
 
 		 553 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.08 
 
 		 552 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.12 
 
 		 555 aa  820    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 554 aa  1138    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.81 
 
 		 552 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.14 
 
 		 554 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.01 
 
 		 552 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.81 
 
 		 552 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.98 
 
 		 550 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  55.46 
 
 		 569 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  55.38 
 
 		 567 aa  626  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  55.44 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  56.16 
 
 		 570 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  54.66 
 
 		 570 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  54.11 
 
 		 571 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  54.04 
 
 		 569 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  54.33 
 
 		 553 aa  601  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  53.12 
 
 		 557 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  52.94 
 
 		 559 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  52.03 
 
 		 580 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  52.69 
 
 		 547 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  52.68 
 
 		 565 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  49.28 
 
 		 552 aa  545  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  47.57 
 
 		 569 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  47.77 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  47.32 
 
 		 552 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.99 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  43.71 
 
 		 562 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 560 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.73 
 
 		 560 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.46 
 
 		 560 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.91 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  43 
 
 		 578 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.29 
 
 		 560 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 		 578 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.71 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.96 
 
 		 581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.93 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  43.65 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  42.44 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  43.21 
 
 		 567 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  43.05 
 
 		 562 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  41.37 
 
 		 570 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  42.29 
 
 		 545 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  42.01 
 
 		 551 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  39.46 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.03 
 
 		 567 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.76 
 
 		 541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  38.92 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.36 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  38.78 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  38.92 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  38.6 
 
 		 566 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3318  protein translocase subunit YidC  42.03 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  39.29 
 
 		 550 aa  392  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.8 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.25 
 
 		 545 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 541 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.83 
 
 		 543 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.01 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.3 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  38.07 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.05 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.05 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.05 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.43 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  37.34 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  37.45 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  37.45 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  38.93 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  37.45 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  37.45 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  37.16 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  37.34 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  37.41 
 
 		 545 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.61 
 
 		 564 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  36.89 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  37.91 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  39.19 
 
 		 528 aa  365  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.98 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  39.19 
 
 		 528 aa  365  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.98 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.98 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>