More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1784 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 557 aa  1139    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  78.1 
 
 		 557 aa  924    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.96 
 
 		 554 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.14 
 
 		 554 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.62 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.66 
 
 		 550 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.38 
 
 		 555 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.41 
 
 		 555 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.77 
 
 		 552 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.77 
 
 		 552 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.18 
 
 		 554 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.18 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 558 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.49 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 558 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 558 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.62 
 
 		 555 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.18 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  50 
 
 		 552 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  50 
 
 		 552 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.82 
 
 		 557 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  45.03 
 
 		 569 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  45.08 
 
 		 559 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  46.62 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  43.94 
 
 		 571 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  43.08 
 
 		 580 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  45.5 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  43.88 
 
 		 567 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  44.68 
 
 		 547 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  45.07 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  44.39 
 
 		 565 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  44.33 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  44.35 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  42.15 
 
 		 569 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  42.53 
 
 		 565 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  42.38 
 
 		 562 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  45.24 
 
 		 546 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 		 563 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.45 
 
 		 560 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  43.29 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.03 
 
 		 560 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.21 
 
 		 560 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.21 
 
 		 560 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 		 557 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.85 
 
 		 560 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.5 
 
 		 581 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  37.79 
 
 		 545 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.81 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 		 578 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  40.79 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  42.19 
 
 		 562 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  38.42 
 
 		 556 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  41.22 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  38.13 
 
 		 570 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  37.89 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.53 
 
 		 575 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.65 
 
 		 567 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.88 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  39.73 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  36.45 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  36.32 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  35.85 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  35.85 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  35.85 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  35.85 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  36.14 
 
 		 541 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  35.96 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  37.61 
 
 		 551 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.2 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  35.96 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  36.7 
 
 		 566 aa  364  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.63 
 
 		 543 aa  363  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  36.52 
 
 		 566 aa  362  9e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3318  protein translocase subunit YidC  41.81 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.34 
 
 		 544 aa  360  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.51 
 
 		 543 aa  359  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.77 
 
 		 565 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  35.56 
 
 		 543 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.17 
 
 		 543 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.87 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  37.26 
 
 		 550 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.81 
 
 		 541 aa  353  7e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  35.15 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.4 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 		 548 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  36.19 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.77 
 
 		 564 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  36.11 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.01 
 
 		 541 aa  347  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.4 
 
 		 548 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  37.19 
 
 		 548 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  35.47 
 
 		 542 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 		 548 aa  345  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>