More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3623 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  62.82 
 
 		 530 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 542 aa  1107    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  56.64 
 
 		 536 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  54.71 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  52.66 
 
 		 528 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  49.82 
 
 		 536 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  50.46 
 
 		 537 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  42.46 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  42.19 
 
 		 559 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  39.16 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  37.23 
 
 		 553 aa  336  7.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  38.84 
 
 		 556 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  37.91 
 
 		 536 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.06 
 
 		 550 aa  330  6e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  38.93 
 
 		 539 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.89 
 
 		 550 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  37.09 
 
 		 562 aa  317  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  36.79 
 
 		 528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  36.79 
 
 		 528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.64 
 
 		 552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  37.18 
 
 		 552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  38.86 
 
 		 534 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.11 
 
 		 552 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.85 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.85 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 558 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 558 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 558 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  34.57 
 
 		 562 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.52 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.8 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  35.83 
 
 		 550 aa  300  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  38.6 
 
 		 548 aa  299  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.45 
 
 		 560 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 		 560 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.7 
 
 		 553 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.91 
 
 		 552 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.91 
 
 		 552 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 563 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.96 
 
 		 567 aa  296  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.34 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  33.11 
 
 		 605 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  36.9 
 
 		 545 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.45 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.33 
 
 		 555 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.41 
 
 		 541 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.34 
 
 		 553 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  34.44 
 
 		 624 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.83 
 
 		 595 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.1 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  36.25 
 
 		 604 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  33.85 
 
 		 600 aa  289  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  33.56 
 
 		 614 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  32.55 
 
 		 547 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.58 
 
 		 584 aa  286  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  34.94 
 
 		 552 aa  286  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 		 616 aa  286  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 		 607 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  32.55 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  32.59 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  36.75 
 
 		 545 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  33.52 
 
 		 617 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 		 577 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  33.39 
 
 		 616 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  34.74 
 
 		 556 aa  279  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.74 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.57 
 
 		 567 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 		 541 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  35.44 
 
 		 541 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  35.26 
 
 		 541 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.07 
 
 		 614 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  35.34 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.86 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.5 
 
 		 597 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  35.26 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  33.45 
 
 		 557 aa  277  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  34.56 
 
 		 556 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.54 
 
 		 554 aa  276  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.65 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  34.93 
 
 		 541 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.74 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.78 
 
 		 544 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  38.93 
 
 		 551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  34.72 
 
 		 541 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  34.72 
 
 		 541 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  34.72 
 
 		 541 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  34.72 
 
 		 541 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.66 
 
 		 578 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 548 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 597 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.38 
 
 		 600 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.48 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>