More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1917 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  59.4 
 
 		 536 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  69.07 
 
 		 539 aa  774    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 534 aa  1097    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  54.09 
 
 		 548 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  53.38 
 
 		 550 aa  571  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  53.07 
 
 		 534 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  41.23 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  41.08 
 
 		 536 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  40.33 
 
 		 536 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  38.49 
 
 		 542 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  40.91 
 
 		 537 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  38.67 
 
 		 528 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  39.16 
 
 		 542 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  38.39 
 
 		 553 aa  340  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  38.28 
 
 		 530 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  39.06 
 
 		 559 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  36.93 
 
 		 547 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.66 
 
 		 556 aa  313  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.68 
 
 		 575 aa  312  7.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  36.1 
 
 		 562 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.49 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  35.68 
 
 		 569 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.08 
 
 		 554 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.95 
 
 		 541 aa  303  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.74 
 
 		 555 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.32 
 
 		 555 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.92 
 
 		 550 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  35.08 
 
 		 545 aa  296  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.03 
 
 		 560 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 553 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  36.96 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.48 
 
 		 567 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  33.75 
 
 		 552 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  34.66 
 
 		 556 aa  293  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  34.3 
 
 		 556 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 		 560 aa  293  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  35.14 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 558 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 558 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 558 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.5 
 
 		 560 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  35.31 
 
 		 562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.5 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.5 
 
 		 560 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.97 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.81 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.81 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.27 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.97 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.97 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  34.04 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 557 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  34.12 
 
 		 528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.33 
 
 		 563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.71 
 
 		 553 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  34.12 
 
 		 528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.5 
 
 		 552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  33.88 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  33.88 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.5 
 
 		 555 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.25 
 
 		 578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  33.88 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  33.88 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.79 
 
 		 578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.22 
 
 		 567 aa  283  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  34.25 
 
 		 541 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.8 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  34.12 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.52 
 
 		 541 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  33.94 
 
 		 541 aa  280  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 541 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  33.94 
 
 		 541 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  35.87 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.73 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.36 
 
 		 581 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  32.72 
 
 		 545 aa  276  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  33.52 
 
 		 542 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.12 
 
 		 551 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.27 
 
 		 518 aa  273  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  32.79 
 
 		 540 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  33.4 
 
 		 566 aa  273  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  41.69 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 		 543 aa  272  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.62 
 
 		 544 aa  270  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  31.6 
 
 		 542 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  34.97 
 
 		 546 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  33.22 
 
 		 570 aa  267  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  32.56 
 
 		 565 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.03 
 
 		 544 aa  266  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.41 
 
 		 614 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.76 
 
 		 600 aa  264  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  32 
 
 		 632 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  33.52 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  35.53 
 
 		 569 aa  264  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>