More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2139 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 		 550 aa  1134    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  52.64 
 
 		 534 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  51.91 
 
 		 539 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  52.17 
 
 		 536 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  53.28 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  44.75 
 
 		 548 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 		 536 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  38.43 
 
 		 537 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  40.35 
 
 		 553 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  37.23 
 
 		 542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  37.68 
 
 		 528 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  38.59 
 
 		 531 aa  346  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  37.06 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  37.25 
 
 		 547 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.64 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  39.54 
 
 		 552 aa  324  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.24 
 
 		 567 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  36.4 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  38.84 
 
 		 552 aa  316  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  37.81 
 
 		 536 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  35.29 
 
 		 557 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  34.66 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  37.73 
 
 		 559 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.54 
 
 		 575 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.32 
 
 		 554 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.55 
 
 		 554 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 		 553 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 		 554 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 		 554 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  33.79 
 
 		 569 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 		 560 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  38.05 
 
 		 562 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  39.9 
 
 		 545 aa  294  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.42 
 
 		 552 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.42 
 
 		 552 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.42 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.4 
 
 		 555 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.32 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.39 
 
 		 597 aa  289  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.13 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  32.81 
 
 		 556 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.79 
 
 		 555 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.92 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.67 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.13 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  32.63 
 
 		 556 aa  286  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  35.79 
 
 		 566 aa  286  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.04 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.39 
 
 		 545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.45 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.39 
 
 		 560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.22 
 
 		 560 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 558 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 558 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 558 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.04 
 
 		 560 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 557 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.93 
 
 		 541 aa  283  7.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.4 
 
 		 550 aa  282  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.26 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.41 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.51 
 
 		 567 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.39 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.48 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  34.48 
 
 		 570 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  34.78 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.03 
 
 		 597 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  32.45 
 
 		 605 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.03 
 
 		 620 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.56 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  32.79 
 
 		 624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  32.09 
 
 		 614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.76 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.68 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.47 
 
 		 597 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  33.16 
 
 		 550 aa  274  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.02 
 
 		 609 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.27 
 
 		 564 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.68 
 
 		 544 aa  273  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  32.01 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.33 
 
 		 517 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.77 
 
 		 518 aa  270  5e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.07 
 
 		 540 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.85 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.89 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  31.58 
 
 		 589 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  31.76 
 
 		 540 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  36.23 
 
 		 545 aa  267  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.1 
 
 		 623 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  33 
 
 		 548 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.93 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>