More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0376 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  52.16 
 
 		 616 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.19 
 
 		 607 aa  798    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.4 
 
 		 610 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.56 
 
 		 610 aa  799    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  52.8 
 
 		 616 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.59 
 
 		 597 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.54 
 
 		 614 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  52.44 
 
 		 605 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  52.35 
 
 		 617 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  53.21 
 
 		 624 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.2 
 
 		 597 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.87 
 
 		 621 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.74 
 
 		 632 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  53.22 
 
 		 604 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.54 
 
 		 609 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.93 
 
 		 597 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 609 aa  1244    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.84 
 
 		 616 aa  706    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  52.72 
 
 		 614 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.49 
 
 		 620 aa  726    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  53.53 
 
 		 600 aa  650    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.8 
 
 		 629 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.45 
 
 		 621 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.8 
 
 		 622 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.49 
 
 		 612 aa  608  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  51.66 
 
 		 609 aa  605  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.5 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  45.05 
 
 		 592 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.7 
 
 		 628 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.58 
 
 		 623 aa  485  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.58 
 
 		 623 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  44.52 
 
 		 601 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.98 
 
 		 608 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  43.33 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.42 
 
 		 606 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.84 
 
 		 635 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.39 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.22 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.37 
 
 		 626 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.47 
 
 		 584 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.94 
 
 		 600 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.44 
 
 		 579 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.17 
 
 		 579 aa  382  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  34.4 
 
 		 566 aa  359  7e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.24 
 
 		 569 aa  353  7e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  33.28 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  34.08 
 
 		 552 aa  287  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  35.9 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.99 
 
 		 567 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  31.9 
 
 		 570 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.33 
 
 		 575 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31.86 
 
 		 542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.12 
 
 		 553 aa  270  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  30.76 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.72 
 
 		 557 aa  266  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.06 
 
 		 557 aa  265  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.69 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.59 
 
 		 537 aa  264  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.4 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  31.86 
 
 		 536 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.02 
 
 		 550 aa  263  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.28 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.28 
 
 		 560 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  32.3 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  31.26 
 
 		 562 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.85 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 560 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.63 
 
 		 578 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.12 
 
 		 560 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.19 
 
 		 530 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.84 
 
 		 578 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 555 aa  257  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  31.98 
 
 		 547 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.31 
 
 		 563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  32.66 
 
 		 545 aa  253  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  31.23 
 
 		 552 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  31.2 
 
 		 550 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 		 555 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  33.89 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  33.59 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.01 
 
 		 545 aa  251  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  30.6 
 
 		 556 aa  250  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.33 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.33 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  32.1 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  30.57 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.21 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  29.6 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  30.02 
 
 		 556 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  30.88 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  28.88 
 
 		 569 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 		 548 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 		 544 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.56 
 
 		 542 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 		 548 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  31.83 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  32.85 
 
 		 553 aa  246  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>