More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1064 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  91.2 
 
 		 628 aa  1175    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 623 aa  1274    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  99.68 
 
 		 623 aa  1273    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.54 
 
 		 626 aa  791    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.54 
 
 		 608 aa  766    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  65.32 
 
 		 606 aa  784    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.48 
 
 		 635 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.74 
 
 		 616 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  44.62 
 
 		 605 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  44.23 
 
 		 617 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  44.25 
 
 		 614 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  44.98 
 
 		 616 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  44.48 
 
 		 616 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  43.3 
 
 		 624 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.28 
 
 		 595 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  46.13 
 
 		 600 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.23 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.05 
 
 		 597 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.46 
 
 		 597 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.14 
 
 		 597 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.63 
 
 		 614 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.15 
 
 		 632 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.54 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.33 
 
 		 610 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.9 
 
 		 621 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  42.58 
 
 		 604 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.17 
 
 		 610 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.99 
 
 		 622 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  43.41 
 
 		 609 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.3 
 
 		 620 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 		 629 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.58 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.38 
 
 		 612 aa  481  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.39 
 
 		 621 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.24 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  40.96 
 
 		 592 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  43.3 
 
 		 589 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.15 
 
 		 584 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  44.38 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.09 
 
 		 630 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.22 
 
 		 600 aa  399  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.75 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.78 
 
 		 579 aa  375  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  37.01 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  32.9 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.32 
 
 		 542 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  32.34 
 
 		 552 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.41 
 
 		 542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.1 
 
 		 550 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.9 
 
 		 547 aa  250  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.57 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  31.27 
 
 		 536 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  30.91 
 
 		 552 aa  246  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 543 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.27 
 
 		 543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.6 
 
 		 541 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.66 
 
 		 567 aa  243  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  31.26 
 
 		 531 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 		 554 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.5 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  34.16 
 
 		 559 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 		 554 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.11 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 		 545 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.73 
 
 		 541 aa  240  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.4 
 
 		 555 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.08 
 
 		 537 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  31.51 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.24 
 
 		 553 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.04 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 557 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 558 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 558 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 558 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.7 
 
 		 552 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.89 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 555 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.14 
 
 		 555 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.95 
 
 		 558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.75 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.1 
 
 		 528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.08 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  30.36 
 
 		 562 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.08 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  29.45 
 
 		 550 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  29.89 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  30.13 
 
 		 530 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  30.76 
 
 		 528 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  30.76 
 
 		 528 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.16 
 
 		 545 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  29.19 
 
 		 570 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.95 
 
 		 565 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  30.18 
 
 		 551 aa  232  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  31.78 
 
 		 534 aa  230  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.98 
 
 		 578 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  30.54 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>