More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3617 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 577 aa  1162    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.29 
 
 		 600 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.31 
 
 		 584 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  45.01 
 
 		 604 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.52 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.19 
 
 		 595 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.35 
 
 		 597 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.13 
 
 		 597 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.1 
 
 		 609 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.85 
 
 		 616 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  44.97 
 
 		 605 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  44.27 
 
 		 600 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  44.61 
 
 		 624 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.37 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.43 
 
 		 607 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  42.86 
 
 		 617 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.53 
 
 		 632 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.26 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.39 
 
 		 609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.09 
 
 		 610 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  41.62 
 
 		 614 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.57 
 
 		 628 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.92 
 
 		 629 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  42.02 
 
 		 616 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.24 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  42.02 
 
 		 616 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.24 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.27 
 
 		 621 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.89 
 
 		 620 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.03 
 
 		 606 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  45.14 
 
 		 601 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.42 
 
 		 622 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.79 
 
 		 608 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.74 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.23 
 
 		 635 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  42.46 
 
 		 589 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.97 
 
 		 626 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  40.77 
 
 		 609 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  40.69 
 
 		 592 aa  422  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.64 
 
 		 630 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.93 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 		 612 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.35 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 569 aa  359  8e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  35.4 
 
 		 566 aa  349  6e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  31.85 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.51 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  31.62 
 
 		 542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  34.55 
 
 		 547 aa  260  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  32.52 
 
 		 550 aa  256  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.81 
 
 		 528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  31.94 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.59 
 
 		 530 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.99 
 
 		 567 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  31.02 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  30.14 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.18 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 548 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 548 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 548 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  31.82 
 
 		 551 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 		 548 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  30.5 
 
 		 552 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.6 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  30.4 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.76 
 
 		 550 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  32.51 
 
 		 559 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.94 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.4 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.47 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.03 
 
 		 552 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.82 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  32.14 
 
 		 546 aa  241  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  32.54 
 
 		 569 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 		 550 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  31.43 
 
 		 541 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.3 
 
 		 537 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.52 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  31.23 
 
 		 570 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 		 558 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 		 558 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.76 
 
 		 543 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 		 558 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 		 558 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.34 
 
 		 557 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.72 
 
 		 555 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  27.7 
 
 		 543 aa  237  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.58 
 
 		 545 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>