More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1048 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.17 
 
 
610 aa  700    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.07 
 
 
597 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.78 
 
 
607 aa  696    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
612 aa  1258    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.01 
 
 
610 aa  699    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.41 
 
 
597 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  49.92 
 
 
604 aa  621  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.49 
 
 
609 aa  621  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.45 
 
 
620 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.08 
 
 
597 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  47.71 
 
 
614 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  47.39 
 
 
616 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  48.6 
 
 
617 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  48.6 
 
 
605 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  46.91 
 
 
616 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.36 
 
 
616 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  48.3 
 
 
624 aa  595  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  47.96 
 
 
600 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  48.11 
 
 
609 aa  585  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.74 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.02 
 
 
614 aa  568  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.38 
 
 
632 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.47 
 
 
629 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.83 
 
 
622 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.24 
 
 
621 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.02 
 
 
621 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.63 
 
 
628 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.87 
 
 
623 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  42.18 
 
 
592 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.38 
 
 
623 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.39 
 
 
595 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.61 
 
 
626 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.26 
 
 
608 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.24 
 
 
606 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
635 aa  459  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 
589 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.95 
 
 
584 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.84 
 
 
630 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  43.61 
 
 
601 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.1 
 
 
600 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.12 
 
 
579 aa  392  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.3 
 
 
579 aa  384  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  35.06 
 
 
566 aa  364  2e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.71 
 
 
556 aa  294  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 
575 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  36.9 
 
 
542 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  31.1 
 
 
570 aa  262  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.49 
 
 
557 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.51 
 
 
567 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.82 
 
 
528 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  30.45 
 
 
557 aa  261  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  30.15 
 
 
562 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  33.59 
 
 
537 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  30.25 
 
 
551 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  34.06 
 
 
536 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.2 
 
 
550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  33.53 
 
 
559 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.16 
 
 
553 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  30.11 
 
 
541 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.76 
 
 
560 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.05 
 
 
566 aa  253  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
560 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.68 
 
 
563 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  29.37 
 
 
541 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  30 
 
 
541 aa  251  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.87 
 
 
552 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
560 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
560 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.32 
 
 
560 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.62 
 
 
542 aa  249  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  28.95 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  29.11 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  28.95 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  28.95 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.95 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  29.68 
 
 
550 aa  248  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.65 
 
 
554 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.91 
 
 
550 aa  246  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  28.55 
 
 
541 aa  246  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.65 
 
 
554 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  29.87 
 
 
562 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.05 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  33.27 
 
 
530 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.83 
 
 
557 aa  243  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  33.27 
 
 
552 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.63 
 
 
552 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  29.26 
 
 
542 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 
554 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.63 
 
 
552 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  31.17 
 
 
546 aa  242  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  28.5 
 
 
545 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.63 
 
 
552 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.45 
 
 
578 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 
554 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.43 
 
 
553 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.83 
 
 
558 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.83 
 
 
558 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>