More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1361 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  84.92 
 
 		 610 aa  1080    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  85.08 
 
 		 610 aa  1082    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 607 aa  1252    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.43 
 
 		 612 aa  685    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.51 
 
 		 597 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.5 
 
 		 614 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  54.28 
 
 		 616 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.49 
 
 		 616 aa  685    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  54.69 
 
 		 614 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  53.55 
 
 		 616 aa  675    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.07 
 
 		 621 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.22 
 
 		 620 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  54.32 
 
 		 600 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.97 
 
 		 632 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.72 
 
 		 597 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.69 
 
 		 609 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.2 
 
 		 597 aa  811    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.36 
 
 		 609 aa  809    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  55.63 
 
 		 605 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  54.17 
 
 		 617 aa  670    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  54.77 
 
 		 624 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  53.19 
 
 		 604 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  51.86 
 
 		 609 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.55 
 
 		 629 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.29 
 
 		 622 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.24 
 
 		 621 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.91 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  43.77 
 
 		 592 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.95 
 
 		 623 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.11 
 
 		 623 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.74 
 
 		 608 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.95 
 
 		 628 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  43.46 
 
 		 589 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.59 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.54 
 
 		 630 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.22 
 
 		 606 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.75 
 
 		 626 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.66 
 
 		 584 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.18 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  41.97 
 
 		 601 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.34 
 
 		 600 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.44 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.12 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.44 
 
 		 569 aa  376  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  35.65 
 
 		 566 aa  362  1e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.85 
 
 		 556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  34.18 
 
 		 557 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.03 
 
 		 567 aa  299  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  33.89 
 
 		 551 aa  293  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  32.4 
 
 		 570 aa  289  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.45 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.03 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 		 575 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.1 
 
 		 548 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  33.63 
 
 		 559 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.1 
 
 		 548 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.1 
 
 		 548 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.95 
 
 		 544 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.1 
 
 		 548 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  32.89 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.97 
 
 		 548 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 560 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.76 
 
 		 560 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  32.52 
 
 		 552 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.57 
 
 		 542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.09 
 
 		 560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.02 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  32.31 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  31.52 
 
 		 548 aa  273  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.09 
 
 		 560 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 		 554 aa  273  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.16 
 
 		 548 aa  273  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.91 
 
 		 560 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  31.32 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 548 aa  272  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 548 aa  272  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  33.14 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 		 554 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 548 aa  272  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  30.62 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.62 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 548 aa  272  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.35 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.35 
 
 		 554 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  34.17 
 
 		 569 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  34.11 
 
 		 570 aa  270  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.62 
 
 		 578 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.7 
 
 		 563 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.04 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 550 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  34.18 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.73 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  34.5 
 
 		 536 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  32.16 
 
 		 550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>