More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0402 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  100 
 
 		 566 aa  1151    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.28 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.84 
 
 		 579 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.4 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  35.65 
 
 		 614 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  37.03 
 
 		 604 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  35.59 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  35.58 
 
 		 617 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.69 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  35.7 
 
 		 616 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  37.28 
 
 		 624 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.72 
 
 		 595 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  35.7 
 
 		 616 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 		 623 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 		 623 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 		 628 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  35.97 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 		 614 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.08 
 
 		 610 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  35.23 
 
 		 589 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.82 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 608 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.54 
 
 		 597 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.68 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.4 
 
 		 609 aa  359  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  34.67 
 
 		 609 aa  359  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.84 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.17 
 
 		 607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.98 
 
 		 616 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.71 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.06 
 
 		 612 aa  353  4e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.55 
 
 		 629 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.77 
 
 		 632 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.4 
 
 		 577 aa  349  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.29 
 
 		 606 aa  348  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.3 
 
 		 621 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 622 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.81 
 
 		 635 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.77 
 
 		 584 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  32.39 
 
 		 592 aa  330  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  36.54 
 
 		 601 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.53 
 
 		 600 aa  321  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 		 630 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.3 
 
 		 621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.55 
 
 		 556 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.46 
 
 		 542 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  31.02 
 
 		 536 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  36.84 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 		 560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  39.56 
 
 		 542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  30.43 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.06 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  29 
 
 		 528 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.06 
 
 		 560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.75 
 
 		 560 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.75 
 
 		 560 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  33.26 
 
 		 531 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  30.71 
 
 		 559 aa  217  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  30.71 
 
 		 551 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.68 
 
 		 578 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  36.45 
 
 		 553 aa  211  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.65 
 
 		 563 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.09 
 
 		 553 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.71 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.92 
 
 		 581 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.1 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  37.96 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  32.43 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.85 
 
 		 557 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.69 
 
 		 575 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  33.91 
 
 		 536 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  32.39 
 
 		 544 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  34.83 
 
 		 566 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.12 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.38 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.04 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  31.98 
 
 		 544 aa  203  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  37.42 
 
 		 530 aa  203  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.14 
 
 		 541 aa  203  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.53 
 
 		 567 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  35.34 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  32.07 
 
 		 545 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  31.55 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  30.89 
 
 		 543 aa  200  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  32.32 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.03 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.22 
 
 		 541 aa  200  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  32.54 
 
 		 562 aa  200  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  29.84 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.62 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  36.36 
 
 		 557 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  32.32 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  44.4 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  37.03 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  32.68 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  29.2 
 
 		 540 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.76 
 
 		 541 aa  198  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  32.68 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>