More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7326 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  59.94 
 
 		 616 aa  759    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.33 
 
 		 610 aa  685    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.33 
 
 		 610 aa  684    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  55.24 
 
 		 616 aa  691    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  54.18 
 
 		 600 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  54.92 
 
 		 616 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.01 
 
 		 597 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.01 
 
 		 597 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  53.88 
 
 		 605 aa  688    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.3 
 
 		 614 aa  950    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  55.16 
 
 		 604 aa  691    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 621 aa  1272    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  71.57 
 
 		 629 aa  903    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  73.11 
 
 		 632 aa  954    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  71.52 
 
 		 621 aa  893    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  71.98 
 
 		 609 aa  928    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.84 
 
 		 597 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  54 
 
 		 609 aa  669    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  55.06 
 
 		 624 aa  693    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.87 
 
 		 609 aa  683    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.43 
 
 		 620 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.91 
 
 		 607 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  57.35 
 
 		 617 aa  727    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  54.85 
 
 		 614 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.21 
 
 		 622 aa  885    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.97 
 
 		 595 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.02 
 
 		 612 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.68 
 
 		 606 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  43.82 
 
 		 592 aa  508  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.14 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.15 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.39 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.39 
 
 		 623 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.25 
 
 		 608 aa  498  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.23 
 
 		 630 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  42.33 
 
 		 589 aa  485  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  44.98 
 
 		 601 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.57 
 
 		 626 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.97 
 
 		 584 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.74 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.78 
 
 		 600 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.42 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.6 
 
 		 579 aa  414  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.79 
 
 		 569 aa  389  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  35.3 
 
 		 566 aa  340  4e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  33.5 
 
 		 556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  34.3 
 
 		 570 aa  291  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  33.17 
 
 		 552 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.69 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  31.44 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.56 
 
 		 567 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 		 575 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  32.96 
 
 		 569 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  32.59 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.44 
 
 		 553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.4 
 
 		 554 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.84 
 
 		 551 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.45 
 
 		 578 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.2 
 
 		 554 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  32.74 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.45 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.87 
 
 		 560 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.92 
 
 		 552 aa  267  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  33.15 
 
 		 562 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31.41 
 
 		 542 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.93 
 
 		 560 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  32.15 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  33.7 
 
 		 557 aa  265  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.93 
 
 		 560 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.23 
 
 		 550 aa  264  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.76 
 
 		 560 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.86 
 
 		 552 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  31.77 
 
 		 547 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.12 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.12 
 
 		 554 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 558 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 558 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 558 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.1 
 
 		 557 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.35 
 
 		 555 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.06 
 
 		 555 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  31.6 
 
 		 536 aa  260  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.1 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.03 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.1 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  33.9 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  32.28 
 
 		 530 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  33.09 
 
 		 559 aa  258  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  32.74 
 
 		 546 aa  257  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.51 
 
 		 544 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  32.34 
 
 		 562 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.56 
 
 		 542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  31.51 
 
 		 580 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.59 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.3 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  31.28 
 
 		 567 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>