More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0458 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  100 
 
 		 592 aa  1204    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  46.99 
 
 		 614 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  46.67 
 
 		 616 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  46.53 
 
 		 604 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  46.18 
 
 		 616 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  45.4 
 
 		 617 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.9 
 
 		 614 aa  535  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.45 
 
 		 609 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.44 
 
 		 616 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.95 
 
 		 610 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.95 
 
 		 610 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  45.33 
 
 		 600 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.05 
 
 		 609 aa  525  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.77 
 
 		 607 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  44.98 
 
 		 605 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  43.79 
 
 		 624 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.01 
 
 		 632 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.73 
 
 		 597 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  44.03 
 
 		 609 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.96 
 
 		 622 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.18 
 
 		 629 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.45 
 
 		 621 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.22 
 
 		 620 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.33 
 
 		 597 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.02 
 
 		 595 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.33 
 
 		 597 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 621 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.18 
 
 		 612 aa  484  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.3 
 
 		 626 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.29 
 
 		 630 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.96 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.96 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.77 
 
 		 628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.55 
 
 		 608 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.91 
 
 		 606 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  41.43 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.02 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 		 577 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  39.46 
 
 		 601 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.92 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.27 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.24 
 
 		 579 aa  349  6e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.04 
 
 		 579 aa  347  4e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  32.39 
 
 		 566 aa  330  4e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.24 
 
 		 556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.67 
 
 		 569 aa  320  5e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  31.09 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.55 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.28 
 
 		 575 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.26 
 
 		 560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.62 
 
 		 557 aa  270  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  36.44 
 
 		 559 aa  270  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.41 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.41 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  33.79 
 
 		 550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.89 
 
 		 560 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.95 
 
 		 560 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.95 
 
 		 560 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.18 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  33.58 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.48 
 
 		 550 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  32.21 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.98 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  41.14 
 
 		 562 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  29.74 
 
 		 545 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  30.36 
 
 		 541 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  30.19 
 
 		 541 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  30.19 
 
 		 541 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.42 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  30.19 
 
 		 541 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  29.64 
 
 		 543 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.33 
 
 		 563 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.48 
 
 		 544 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.1 
 
 		 541 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.41 
 
 		 541 aa  258  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  30.21 
 
 		 557 aa  257  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.12 
 
 		 567 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  30.86 
 
 		 566 aa  257  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.33 
 
 		 560 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.68 
 
 		 565 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  31.25 
 
 		 547 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  29.74 
 
 		 542 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.12 
 
 		 564 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  29.98 
 
 		 541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.02 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.78 
 
 		 553 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.1 
 
 		 541 aa  254  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  30.65 
 
 		 541 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  30.02 
 
 		 541 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 555 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  30.28 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.52 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  29.98 
 
 		 541 aa  251  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  31.56 
 
 		 552 aa  249  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.53 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  30.92 
 
 		 544 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  32.43 
 
 		 570 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.61 
 
 		 555 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  29.9 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  31.38 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>