More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2141 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
601 aa  1222    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  47.64 
 
 
589 aa  561  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.64 
 
 
595 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.33 
 
 
614 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.88 
 
 
616 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  46.09 
 
 
616 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  45.44 
 
 
614 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  44.63 
 
 
616 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  44.72 
 
 
617 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.21 
 
 
597 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.26 
 
 
609 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.05 
 
 
609 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.23 
 
 
610 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.81 
 
 
610 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.9 
 
 
621 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.02 
 
 
621 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  42.74 
 
 
605 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.38 
 
 
632 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.36 
 
 
607 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.9 
 
 
629 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.67 
 
 
577 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  44.5 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.08 
 
 
622 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  42.33 
 
 
600 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  42.25 
 
 
609 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.6 
 
 
623 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.45 
 
 
597 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.67 
 
 
628 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.63 
 
 
635 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.15 
 
 
597 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.53 
 
 
620 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.6 
 
 
623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.25 
 
 
584 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  41.6 
 
 
604 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.18 
 
 
608 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  39.46 
 
 
592 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.13 
 
 
612 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.96 
 
 
626 aa  425  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.62 
 
 
606 aa  425  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.52 
 
 
600 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.77 
 
 
630 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.76 
 
 
579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.99 
 
 
579 aa  388  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.13 
 
 
569 aa  374  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  36.54 
 
 
566 aa  329  1.0000000000000001e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.27 
 
 
556 aa  320  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.79 
 
 
560 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  31.22 
 
 
542 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  30.54 
 
 
551 aa  264  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.45 
 
 
560 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.28 
 
 
560 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.28 
 
 
560 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.57 
 
 
560 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.57 
 
 
581 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 
567 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
553 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 
550 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  43.12 
 
 
562 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 
575 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  31.98 
 
 
547 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.58 
 
 
554 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.54 
 
 
557 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  32.68 
 
 
531 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.87 
 
 
563 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
545 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  31.95 
 
 
528 aa  251  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  30.95 
 
 
570 aa  250  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
554 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.05 
 
 
557 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  29.35 
 
 
550 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  30.94 
 
 
562 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.93 
 
 
555 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.53 
 
 
578 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.89 
 
 
558 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.89 
 
 
558 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.89 
 
 
558 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 
548 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 
548 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 
548 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.89 
 
 
558 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  30.76 
 
 
536 aa  247  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.53 
 
 
578 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 
548 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  31 
 
 
543 aa  246  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.89 
 
 
558 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.83 
 
 
548 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.89 
 
 
558 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.89 
 
 
558 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.6 
 
 
548 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 
544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.45 
 
 
543 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.86 
 
 
555 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.81 
 
 
557 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.96 
 
 
552 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.31 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.31 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.96 
 
 
552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.38 
 
 
552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.38 
 
 
552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.34 
 
 
542 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>