More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0640 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 630 aa  1290    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.02 
 
 		 616 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  44.57 
 
 		 600 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.15 
 
 		 632 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  43.91 
 
 		 617 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.01 
 
 		 620 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  43.44 
 
 		 604 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  44.87 
 
 		 605 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.55 
 
 		 614 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.35 
 
 		 621 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  43.32 
 
 		 616 aa  492  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.11 
 
 		 609 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.33 
 
 		 629 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.16 
 
 		 597 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  42.86 
 
 		 616 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.97 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  42.95 
 
 		 614 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  42.28 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.9 
 
 		 622 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.48 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.48 
 
 		 610 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.44 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  41.67 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.19 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  41.29 
 
 		 592 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.6 
 
 		 607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.22 
 
 		 609 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.23 
 
 		 621 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 		 628 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.09 
 
 		 623 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.09 
 
 		 623 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.26 
 
 		 608 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.84 
 
 		 612 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  39.48 
 
 		 589 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.64 
 
 		 577 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  42.78 
 
 		 601 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.26 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.48 
 
 		 606 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.33 
 
 		 584 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.13 
 
 		 635 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.45 
 
 		 600 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.83 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.59 
 
 		 579 aa  362  2e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.25 
 
 		 569 aa  332  9e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  32.17 
 
 		 566 aa  315  9.999999999999999e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  30.74 
 
 		 556 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  31.65 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.33 
 
 		 552 aa  239  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.36 
 
 		 575 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.39 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  31.12 
 
 		 545 aa  226  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  29.93 
 
 		 542 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  29.24 
 
 		 551 aa  224  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  28.73 
 
 		 570 aa  220  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 		 554 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.92 
 
 		 557 aa  217  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.15 
 
 		 547 aa  216  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.25 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.88 
 
 		 567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 565 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 		 546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 		 546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 		 546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.14 
 
 		 548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  29.27 
 
 		 536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.52 
 
 		 541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.8 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  32.46 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  29.3 
 
 		 562 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.71 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  29.38 
 
 		 557 aa  210  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.99 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.83 
 
 		 545 aa  210  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 548 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 548 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 		 564 aa  210  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4043  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.3 
 
 		 571 aa  210  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 548 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 548 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.91 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.45 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  29.98 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.74 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  30.05 
 
 		 551 aa  209  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.78 
 
 		 555 aa  208  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 		 569 aa  207  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.07 
 
 		 566 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  40.29 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  28.16 
 
 		 534 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 548 aa  207  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  28.65 
 
 		 537 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.25 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>